Animierte Daten zu Wildtierbewegungen für Forscher, Naturschützer und Stadtplaner

Open-Source-App beschleunigt neue Umweltentdeckungen


Für ein ausgewogenes Zusammenleben zwischen Wildtieren und dem wachsenden ökologischen Fußabdruck des Menschen ist die Verfolgung und Kartierung von Tierwanderungsmustern von entscheidender Bedeutung. Mit Daten zu Migrationsmustern und Lebensräumen können Stadtplaner und Umweltschützer Entwicklungs- und Bauprojekte steuern und dabei die Bedürfnisse der Wildtierpopulationen mit denen der menschlichen Gemeinschaften in Einklang bringen.

Gil Bohrer, Professor für Bau-, Umwelt- und Geodäsietechnik an der Ohio State University, hat Jahre damit verbracht, Werkzeuge zur Analyse von Daten zu Tierbewegungen zu entwickeln, darunter Environmental-Data Automated Track Annotation (Env-DATA), um Fernerkundungsdaten mit Tierspuren zu verknüpfen. Er und sein Team erstellten Visualisierungen, um Tierbewegungen darzustellen.

„Alle haben es immer geliebt“, sagt er.

Nach dem Start von Env-DATA im Jahr 2011 wandten sich häufig Forscher mit Tierdaten an ihn und baten ihn um Hilfe beim Erstellen von Analysetools und Animationen. Als das NASA Ecological Forecasting Program Bohrer, Entwicklerin Justine Missik und User-Outreach-Spezialistin Sarah Davidson die Möglichkeit bot, der Community von Benutzern, die Tierbewegungen verfolgen, Datenanalysen zur Verfügung zu stellen, verfügte Bohrer also über reichlich Erfahrung.

Bohrer organisierte eine Koalition von Endnutzern und startete Room to Roam: Wildtierbewegungen vom Yellowstone zum Yukon (Room2Roam). Das Ziel dieser Initiative besteht darin, ein umfassendes Archiv mit Daten zur Tierwanderung in der Region aufzubauen und so eine wertvolle Ressource sowohl für die Forschung als auch für praktische Anwendungen im Bereich Wildtier- und Ressourcenmanagement bereitzustellen. Mit diesen Daten kann Room2Roam Werkzeuge entwickeln, um das Wildtiermanagement zu verbessern, die Effektivität geschützter Gebiete zu bewerten, die Migration und Bewegung von Wildtieren einzuschätzen und Schutzstrategien im Wildtierkorridor von Yellowstone nach Yukon (Y2Y) zu priorisieren.

Weltkarte mit Projekten auf allen Kontinenten.

Movebank beherbergt mittlerweile 6,5 Milliarden Tierstandorte. Markierungen stellen Projekte dar, die von 4.300 Benutzern weltweit verwaltet werden. (Bildquelle: Max-Planck-Institut für Verhaltensbiologie

Ein Wildtierkorridor ist ein Durchgang oder ein verbundener Streifen natürlichen, geschützten Landes, der es Tieren ermöglicht, sich zwischen Bereichen mit geeignetem Lebensraum zu bewegen, die sonst durch die menschliche Entwicklung zerstückelt werden könnten. Wildtierkorridore bieten den Tieren sichere Wanderrouten, auf denen sie auf ihrem Weg zwischen Futter- und Brutplätzen Nahrung und Schutz finden.

Der Y2Y-Wildtierkorridor, einer der größten der Welt, erstreckt sich über mehr als 3.370 Kilometer vom Großraum Yellowstone im Westen der USA bis zum Polarkreis im kanadischen Yukon-Territorium. Laut der Yellowstone to Yukon Conservation Initiative erstreckt sich das Gebiet über fünf amerikanische Staaten, zwei kanadische Provinzen, zwei kanadische Territorien und mindestens 75 indigene Territorien. Die Weite umfasst Berg-, Wald- und Graslandökosysteme, die Grizzlybären, Karibus, Wölfe und zahlreiche Vogelarten, darunter den Steinadler, beherbergen.

Die Tierverfolgungsdaten von Room2Roam befinden sich auf Movebank, einer globalen Plattform zum Hosten und Zugreifen auf Tierbewegungsdaten, die von an Tieren angebrachten Sensoren erfasst werden. Die Movebank-Site wurde 2008 vom Max-Planck-Institut für Verhaltensbiologie, dem North Carolina Museum of Natural Sciences und der Universität Konstanz ins Leben gerufen und enthält mittlerweile über 6 Milliarden Standorte weltweit. Über 4.300 Teilnehmer tragen Daten bei.

In der Vergangenheit lag der Schwerpunkt der geförderten Projekte auf akademischen Ergebnissen, beispielsweise Forschungsarbeiten. Room2Room hingegen priorisiert die Bedürfnisse der Praktiker, so Davidson, der auch Datenkurator für Movebank und Koordinator von Room2Roam ist.

Dieser neue Ansatz hat dazu geführt, dass Room2Roam die Endbenutzer direkt einbezieht. Bei ihrem ersten Benutzertreffen trafen sich Bohrer und die Projektleiter von Room2Roam mit fast 40 Vertretern von Behörden und Naturschutzgruppen, die im Wildtierkorridor tätig sind, um Feedback für die Entwicklung von Tools für die Region zu sammeln. Eine der Top-Anfragen: Visualisierung

Karte von Kanada und den Vereinigten Staaten, die den Migrationskorridor von Yellowstone nach Yukon (Y2Y) hervorhebt und Daten zur Tierverfolgung innerhalb des Korridors zeigt.

Der Wildtierkorridor von Yellowstone nach Yukon erstreckt sich über mehr als 3.370 Kilometer vom Greater Yellowstone Ecosystem im Westen der USA bis zum Polarkreis im kanadischen Yukon-Territorium. (Bildquelle: Max-Planck-Institut für Verhaltensbiologie

„Jeder wollte Animationen für seine Daten“, sagt Bohrer.

Erstellen des Tools

Bohrer verwendete MATLAB® um Visualisierungen für seine Arbeit zu erstellen. Er wandte sich an MathWorks, um das Room2Roam-Projekt zu finanzieren und daran mitzuarbeiten, da er wusste, dass MATLAB dieser Herausforderung gewachsen war. „Wir brauchten die Rechenleistung von MATLAB, um die große Menge an Tierbewegungs- und Fernerkundungsdaten zu verarbeiten“, sagt er.

„Wir brauchten die Rechenleistung von MATLAB, um die große Menge an Tierbewegungs- und Fernerkundungsdaten verarbeiten zu können.“

Zwei Jahre später startete Room2Roam ECODATA-Animate. Die mit MATLAB erstellte App ermöglicht es Forschern, individuelle Animationen von Tierbewegungen zu erstellen, die auf geografische Karten und dynamische Umweltbeobachtungen gelegt werden. Die App läuft ohne MATLAB Lizenz und offline, sodass Forscher sie auf ihren Laptops ausführen können, auch an entfernten Standorten ohne Internetzugang.

Bohrer, Missik und Davidson haben ECODATA-Animate mit MATLAB App Designer und Mapping Toolbox™ entwickelt. Zur Visualisierung von Wildtierszenen nutzt die App vier Hauptdatentypen: geografische Daten, Daten zu Tierbewegungen, Umweltdaten und Standortdetails wie Straßen und Namen. Es können auch vom Benutzer bereitgestellte Karten im GIS-Format enthalten sein, beispielsweise Karten der geplanten künftigen Entwicklung. MATLAB kombiniert diese verschiedenen Datenebenen zu einer einzigen integrierten Karte.

„Das war ein großer Vorteil“, sagt Bohrer. „Die meisten anderen Tools tun das nicht, weil es nicht trivial ist. Mit MATLAB ist dies ganz einfach zu handhaben.“

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ECODATA-Animate-Karte der Tierbewegungen über einen Zeitraum von einem Jahr. (Videoquelle: Ohio State University)

Forscher und Wildtiermanager wollten mit ihren Daten mehr anfangen, als nur statische Karten zu erstellen. Doch für Forscher ohne fundierte Programmierkenntnisse ist es oft schwierig, auf Grundlage der Daten ein Video oder eine Animation zu erstellen.

Dank der grafischen Benutzeroberfläche von ECODATA-Animate können Forscher jedoch problemlos innerhalb von Minuten oder Stunden lebendige Animationen der Tierbewegungen erstellen. Die Forscher beim Room2Roam-Endbenutzer-Workshop waren erstaunt, wie schnell sie die Daten in leicht verständliche Animationen umwandeln konnten.

„Am Ende des ersten Tages kam ein Teilnehmer auf die Organisatoren zu und sagte: ‚Ich habe gerade diesen Film über den Wald gemacht, den ich seit 20 Jahren studiere‘“, sagt Bohrer.

Die Daten werden zum Leben erweckt

ECODATA-Animate kommt Tierforschern, Parkdiensten, Wildtiermanagern, Landverwaltern und anderen Interessengruppen zugute, die die Bewegungen und Lebensräume von Tieren überwachen. Auch staatliche Stellen, etwa im Transport-, Gesundheits- und Landwirtschaftsbereich, haben ein begründetes Interesse an der Verfolgung der Tierbewegungen.

„Wir verwenden einen Open-Science-Ansatz, um diese Tools zu entwickeln und zu teilen. Dadurch können wir den Informationsaustausch für angewandte und wissenschaftliche Zwecke beschleunigen.“

Im Nordwestterritorium nutzten Forscher eine Animation mehrerer Arten, um zu veranschaulichen, wie unterschiedliche Wildtiere auf Straßen reagieren. Karibus scheuen zurück, was potenziell zu einer Fragmentierung der Populationen führen kann, während Bisons den Routen folgen, was das Risiko von Fahrzeugkollisionen erhöht.

„Die Straße wirkt sich auf beide Arten aus, allerdings auf völlig unterschiedliche Weise“, sagt Bohrer.

Die Animationen können diesen unterschiedlichen Interessengruppen helfen, die Verhaltensmuster und Nachhaltigkeitsanforderungen verschiedener Arten besser zu verstehen und zu kommunizieren.

„Die Möglichkeit, einen einminütigen Film anzusehen, kann den Ausschlag geben, ob die Leute die Notwendigkeit für den Bau einer Wildtierüberführung verstehen oder nicht“, sagt Davidson.

Der Screenshot der ECODATA-Animate-Benutzeroberfläche zeigt, dass Sie die ausgewählten Personen, den Zeitraum oder den geografischen Standort anpassen können.

Die benutzerfreundliche ECODATA-Animate-Schnittstelle zum Hochladen und Animieren von Tierverfolgungsdaten. Der Inhalt der Felder wird automatisch durch hochgeladene Tracking-Daten aufgefüllt und kann aktualisiert werden, um genauer festzulegen, was in die Animation aufgenommen werden soll. (Bildquelle: Ohio State University)

Screenshot der ECODATA-Animate-App auf MATLAB File Exchange.

Professor Bohrer hat die ECODATA-Animate-App und den Code auf GitHub und MATLAB File Exchange geteilt.

Nachdem das Roam2Roam-Team das Tool erstellt hatte, bestand ein weiteres Ziel des NASA-Zuschusses darin, diese Tools Gruppen und Forschern auf der ganzen Welt anzubieten, die mit Tierdaten arbeiten. Obwohl ECODATA-Animate noch in den Kinderschuhen steckt, wächst seine Reichweite rasant, seit Bohrer die App und den Code dahinter auf GitHub® und MATLAB File Exchange geteilt hat.

„Wir verwenden einen Open-Science-Ansatz, um diese Tools zu entwickeln und zu teilen“, erklärt Davidson. „Dadurch können wir den Informationsaustausch für angewandte und wissenschaftliche Zwecke beschleunigen.“

Aufgrund des großen Interesses haben die Mitglieder des Room2Roam-Teams über 30 Präsentationen und Workshops für Forscher- und Praktikergemeinschaften abgehalten, die mehr über die Verwendung der Tools erfahren wollten. Dazu gehören auch einige Menschen in der Algonquin to Adirondacks (A2A) Collaborative, eine Gruppe ähnlich wie Y2Y. A2A schützt einen Wildtierkorridor, der sich über 40.000 Quadratmeilen durch die östlichen Vereinigten Staaten und Kanada erstreckt.

Bohrer sieht weitere Einsatzmöglichkeiten für ECODATA-Animate. Er hofft, Unterstützung für zusätzliche Arten von Beobachtungsdaten hinzufügen zu können, wie etwa eBird, eine Crowdsourcing-Datenbank mit Vogelbeobachtungen, die vom Cornell Lab of Ornithology betrieben wird. Er möchte außerdem eine Split-Screen-Animation für standortbasierte Datentypen wie Kamerafallen erstellen, bei der ein Benutzer auf einen Datenpunkt einer Kamerafalle klicken und auf einem Bildschirm ein Video der Kameraauslösung und auf dem anderen Bildschirm eine Karte mit Daten von allen Kamerastandorten sehen kann. Er plant, MATLAB Tools wie die Wavelet Toolbox™ zu verwenden, um die Arten der Analysen zu erweitern, die auf Daten zu Tierbewegungen angewendet werden.

Eine detaillierte globale Ansicht

Bohrer hörte einmal, wie jemand von der NASA erklärte, dass man überall nichts oder nirgends alles beobachten könne. Mit anderen Worten: Die meisten Forscher beschränken ihre Beobachtungen auf winzige Regionen, während einige groß angelegte Untersuchungen, wie etwa Satelliten, einen umfassenderen, aber groben Blick auf den gesamten Planeten werfen. Die Kombination der beiden Skalen könnte neue Erkenntnisse über unsere Welt liefern.

„Wir müssen all diese Punktbeobachtungen irgendwie zu einem globalen Bild kombinieren“, sagt Bohrer. „Und ohne offenen Datenaustausch wird das nie passieren.“

Indem ECODATA-Animate durch die Verwendung gemeinsamer Daten und Werkzeuge die Hürden bei der Datenverarbeitung, -synthese und -freigabe abbaut, trägt es dazu bei, ein Zeitalter datengesteuerter Erkenntnisse über Tierbewegungen und Umweltveränderungen auf globaler Ebene einzuläuten.

Ein Grund dafür, Daten über das Verhalten von Tieren stärker zu teilen, besteht darin, dass das Markieren und Verfolgen von Tieren einen enormen Aufwand bedeutet. So springt man beispielsweise aus Hubschraubern, um Karibus ein Halsband anzulegen. Oftmals schlummern schwer erkämpfte Daten auf den Laptops der Forscher oder in einem abgeschotteten Archiv.

Um dem entgegenzuwirken, haben Bohrer, Missik und Davidson dafür gesorgt, dass die ECODATA-Tools kostenlos und Open Source sind, ihre Nutzung jedoch keine Offenlegung sensibler Bewegungsdaten gegenüber anderen erfordert. Indem ECODATA-Animate durch die Verwendung gemeinsamer Daten und Werkzeuge die Hürden bei der Datenverarbeitung, -synthese und -freigabe abbaut, trägt es dazu bei, ein Zeitalter datengesteuerter Erkenntnisse über Tierbewegungen und Umweltveränderungen auf globaler Ebene einzuläuten. Diese Erkenntnisse können veröffentlicht werden.

„Wenn in 50 Jahren keine Daten mehr in offenen Archiven vorhanden sind, sind sie verloren – und damit auch unsere Chance, die Welt ganzheitlich zu verstehen“, sagt Bohrer.


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