SimBiology
Modéliser, simuler et analyser des systèmes biologiques
Vous avez des questions ? Contactez l'équipe commerciale.
SimBiology propose des applications et des outils de programmation pour la modélisation, la simulation et l'analyse des systèmes dynamiques, mettant l'accent sur les applications de pharmacologie quantitative des systèmes (QSP), de pharmacocinétique physiologique (PBPK) et de pharmacocinétique/pharmacodynamique (PK/PD). Vous pouvez créer des modèles de manière interactive avec l'éditeur de schéma bloc de SimBiology, ou de manière programmatique avec le langage MATLAB. Vos modèles peuvent être créés à partir de zéro, importés sous forme de fichiers au format SBML ou créés à partir des exemples de modèles fournis dans SimBiology.
SimBiology propose diverses techniques d'analyse de modèles basés sur des équations différentielles ordinaires (ODE), dont la complexité et la taille varient. Vous pouvez exécuter des simulations pour évaluer les cibles thérapeutiques, prédire l'efficacité et la sécurité des médicaments, et identifier les calendriers posologiques optimaux. Vous pouvez identifier des voies et des paramètres clés en utilisant des analyses de sensibilité locales et globales, et évaluer la variabilité biologique en effectuant des balayages de paramètres. Pour estimer les paramètres, vous pouvez ajuster les données à l'aide de techniques de régression non linéaire et de méthodes non linéaires à effets mixtes, et effectuer une analyse non compartimentale (NCA).
Créer des modèles QSP, PBPK et PK/PD
Créez des modèles comme vous les dessineriez sur une feuille de papier dans SimBiology Model Builder ou importez des modèles SBML existants. Utilisez les objets dose et variant pour appliquer des stratégies de dosage (10:00) et stocker des valeurs de quantité alternatives.
Simuler le comportement d'un modèle
Effectuez des simulations avec divers solveurs déterministes et stochastiques en utilisant SimBiology Model Analyzer ou des outils de programmation. La conversion automatique des unités permet d'intégrer toutes les quantités au sein d'un système d'unités cohérent. Générez des rapports à partir des analyses.
Ajuster les données pour estimer les paramètres
Estimez les paramètres en utilisant la régression non linéaire avec des méthodes locales, globales ou hybrides. Calculez les intervalles de confiance des paramètres et des prédictions. Tenez compte des effets fixes et aléatoires avec la modélisation NLME.
Réaliser des simulations de Monte Carlo
Réalisez des scans de paramètres et des simulations de Monte Carlo pour évaluer le comportement du modèle dans différentes conditions et régimes posologiques. Utilisez des curseurs interactifs pour explorer l'impact des variations de quantité sur la réponse du modèle.
Analyses de la sensibilité locale et globale
Découvrez les effets des variations dans les quantités du modèle sur la réponse du modèle en effectuant une analyse de la sensibilité. SimBiology supporte les analyses globales, les analyses de Monte Carlo et les analyses locales basées sur les dérivés.
Analyse non compartimentale
Calculez les paramètres pharmacocinétiques à partir de l'évolution temporelle des concentrations de médicaments sans partir de l'hypothèse d'un modèle compartimental. Réalisez une analyse NCA à la fois sur des données expérimentales et des données de simulation pour des schémas de dosage simple ou multiple.
Accélérer les simulations
Accélérez les grands modèles ou les simulations de Monte Carlo en les convertissant en code C compilé. Améliorez davantage les performances en distribuant les calculs sur plusieurs cœurs, clusters ou ressources cloud avec Parallel Computing Toolbox.
Partager des modèles sous forme d’applications web
Créez des applications dans App Designer, packagez-les avec MATLAB Compiler, puis hébergez-les en utilisant MATLAB Web App Server. Les collaborateurs peuvent accéder aux applications et les exécuter dans un navigateur sans installer de software.
Outils de la communauté
Utilisez SimBiology de manière programmatique avec des scripts MATLAB pour personnaliser et automatiser vos analyses. Les outils fournis par la communauté peuvent être utilisés comme compléments pour l'analyse de modèles, notamment les simulations de populations virtuelles.
Ressources produits :
Demander une version d’essai gratuite
Profitez de 30 jours pour tester.
Prêt à acheter ?
Découvrez les tarifs et les produits.
Vous êtes étudiant ?
Votre établissement propose peut-être déjà un accès à MATLAB, Simulink et d'autres produits complémentaires via la licence Campus-Wide.
