Les spécialistes de la biologie computationnelle utilisent les produits MathWorks pour comprendre et prédire des comportements biologiques en effectuant des analyses de données et des modélisations mathématiques.
Les produits MathWorks proposent un seul environnement intégré pour supporter la pharmacocinétique (PK), la bioinformatique, la biologie des systèmes, le traitement des bioimages et la biostatistique.
Grâce aux produits MathWorks pour la biologie computationnelle, vous pourrez :
- Importer, analyser et modéliser des données, puis partager les résultats
- Automatiser des éléments de workflow
- Personnaliser des algorithmes et des outils essentiels au développement de méthodes innovantes pour travailler dans des domaines de recherche inexplorés
- Exploiter des algorithmes et des outils éprouvés et bénéficiant d’un support commercial
« En général, les chercheurs s’intéressent bien plus aux résultats qu’à la programmation. MATLAB nous permet d’envisager les choses à un niveau d’abstraction plus élevé, et de passer moins de temps sur le développement, le débuggage, les tests et la création de graphiques. Par conséquent, nous obtenons les résultats de recherche plus rapidement. »
Dr Gil Alterovitz, Massachusetts Institute of Technology et Harvard University
Analyse de données pour la biologie computationnelle
Grâce à un environnement intégré pour la biologie computationnelle, les produits MathWorks élimine le besoin d'utiliser une multitude d’outils incompatibles entre eux pour importer et analyser vos données et partager les résultats. Vous pouvez :
- Effectuer de nombreux types d’analyses, comme des modèles non-linéaires à effets mixtes, du séquençage, des biopuces, des arbres phylogénétiques, des spectromètres de masse et de l’ontologie génétique
- Importer des données provenant de plusieurs sources (bases de données, formats de fichier ou hardware)
- Partager vos résultats avec des rapports générés automatiquement au format HTML, des visualisations de données ou des outils autonomes
- Mener des analyses de données en parallèle pour réduire le temps de calcul
- Automatiser les analyses pour implémenter un traitement en mode batch des processus contigus
Modélisation mathématique pour la biologie computationnelle
Les produits MathWorks proposent un environnement unifié pour différents types de modélisation, par exemple la pharmacocinétique (PK) et la biologie des systèmes. Grâce à cet environnement intégré, vous pouvez créer et analyser un modèle afin de prédire et étudier les caractéristiques de votre système biologique. Avec les outils de modélisation graphiques et programmatiques de SimBiology, vous pouvez :
- Analyser et visualiser des données externes, identifier un modèle de PK depuis l’assistant PK Wizard et faire correspondre votre modèle aux données externes
- Implémenter un réseau de réactions pour étudier les dynamiques d’un système
- Combiner des modèles (PK, par exemple) avec un réseau biochimique
- Partager vos résultats avec un rapport généré automatiquement