SimBiology

 

SimBiology

Modellieren, simulieren und analysieren Sie biologische Systeme

Erstellung von QSP-, PBPK- und PK/PD-Modellen

Erstellen Sie Modelle im SimBiology Model Builder so, wie Sie sie auf einem Blatt Papier zeichnen würden oder importieren Sie vorhandene SBML-Modelle. Verwenden Sie die Objekte dose (Dosierung) und variant (Variante), um Dosierungsstrategien (10:00) anzuwenden und alternative Mengenwerte zu speichern.

Simulation des Modellverhaltens

Führen Sie Simulationen mit verschiedenen deterministischen und stochastischen Solvern mithilfe des SimBiology Model Analyzer oder programmatischen Tools durch. Die automatische Einheitenumrechnung bringt alle Größen in ein konsistentes Einheitensystem. Lassen Sie sich Berichte erstellen, die auf den Analysen basieren.

Anpassung von Daten zur Schätzung von Parametern

Schätzen Sie Parameter mithilfe nichtlinearer Regression und unter Verwendung lokaler, globaler oder hybrider Methoden. Berechnen Sie die Parameter und die Konfidenzintervalle der Vorhersagen. Berücksichtigen Sie sowohl feste als auch zufällige Effekte mit der NLME-Modellierung.

Durchführung von Monte-Carlo-Simulationen

Führen Sie Parameterscans und Monte-Carlo-Simulationen durch, um das Modellverhalten unter verschiedenen Bedingungen und Dosierungsschemata zu bewerten. Mit interaktiven Schiebereglern können Sie untersuchen, wie sich Mengenvariationen auf die Reaktion des Modells auswirken.

Globale und lokale Sensitivitätsanalyse

Untersuchen Sie mittels einer Sensitivitätsanalyse die Wirkung variierter Modellmengen auf die Modellreaktion. SimBiology unterstützt globale, Monte-Carlo- und lokale, ableitungsbasierte Analysen.

Kompartimentfreie Analyse

Berechnen Sie PK-Parameter aus dem Zeitverlauf der Arzneimittelkonzentrationen, ohne ein Kompartimentmodell anzunehmen. Führen Sie für einzelne oder mehrere Dosierungsschemata kompartimentfreie Analysen von Experiment- und Simulationsdaten durch.

Beschleunigen von Simulationen

Beschleunigen Sie große Modelle oder Monte-Carlo-Simulationen, indem Sie sie in kompilierten C Code umwandeln. Durch die Verteilung auf mehrere Kerne, Cluster oder Cloud-Ressourcen mit der Parallel Computing Toolbox können Sie die Leistung weiter verbessern.

Gemeinsame Nutzung von Modellen als Web-Apps

Erstellen Sie Apps mit dem App Designer, bündeln Sie diese mit dem MATLAB Compiler und hosten Sie diese Apps mithilfe des MATLAB Web App Server. Alle Beteiligten können über einen Browser auf Anwendungen zugreifen und diese ausführen, ohne Software installieren zu müssen.

Community-Tools

Verwenden Sie SimBiology programmatisch mit MATLAB-Skripten, um Ihre Analysen anzupassen und zu automatisieren. Die gemeinschaftlich erstellten Tools können als Zusatzfunktionen für die Modellanalyse verwendet werden, wie beispielsweise für virtuelle Bevölkerungssimulationen.

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