MATLAB und Simulink auf dem Gebiet der Computational Biology

Biologische Systeme und Daten analysieren, visualisieren und modellieren

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Spezialisten der Computational Biology greifen auf MathWorks Produkte zurück, um biologisches Verhalten mithilfe von Datenanalysen und mathematischer Modellierung zu verstehen und vorherzusagen.

Die Produkte von MathWorks bieten eine einheitliche, integrierte Umgebung zur Unterstützung von Anwendungsgebieten wie der Pharmakokinetik (PK), Bioinformatik, Systembiologie, Biobildverarbeitung und Biostatistik.

Hierfür können Sie MathWorks Produkte für die Computational Biology verwenden:

  • Importieren, Analysieren und Modellieren von Daten und Austausch der Ergebnisse
  • Automatisieren von Workflow-Elementen
  • Anpassen von Algorithmen und Tools, die maßgeblich zur Entwicklung innovativer Methoden für unerforschte Themengebiete beitragen
  • Nutzen von bewährten, kommerziell unterstützten Algorithmen und Tools

„In der Regel sind Wissenschaftler an Ergebnissen interessiert und nicht am Programmieren. MATLAB ermöglicht es uns, auf einer höheren Abstraktionsebene zu denken und dadurch den Zeitaufwand für die Entwicklung, das Debugging, das Testen und die Erstellung von Diagrammen zu verringern. Infolgedessen erhalten wir wesentlich schneller die entsprechenden Forschungsergebnisse.“

Dr. Gil Alterovitz, Massachusetts Institute of Technology und Harvard University

Datenanalyse für Computational Biology

Durch die Nutzung einer integrierten Umgebung für die Computational Biology machen MathWorks Produkte die Arbeit mit separaten, inkompatiblen Tools für den Import, die Analyse und den Austausch von Ergebnissen überflüssig. Folgende Möglichkeiten stehen Ihnen u. a. zur Verfügung:

  • Durchführung eines Spektrums von Analysen, darunter nichtlineare gemischte Effekte, Sequenz, Microarray, phylogenetischer Baum, Massenspektrometrie und Gen-Ontologie
  • Import von Daten aus verschiedenen Quellen, wie Datenbanken, Dateiformaten oder Hardware
  • Austausch von Ergebnissen mit automatisch generierten HTML-Berichten, Datenvisualisierungen oder eigenständigen Tools
  • Parallelisierung der Datenanalyse zur Verkürzung der Berechnungszeit
  • Automatisierung von Analysen zur Umsetzung der Stapelverarbeitung zusammenhängender Prozesse
SimBiology

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SimBiology Model Builder

Mathematische Modellierung im Bereich der Computational Biology

Die Produkte von MathWorks bieten eine einheitliche Umgebung für verschiedene Modellierungsarten, wie beispielsweise die Pharmakokinetik (PK) und die Systembiologie. Die integrierte Umgebung ermöglicht es Ihnen, ein Modell zu erstellen und zu analysieren, um die Eigenschaften Ihres biologischen Systems genau vorherzusagen und zu untersuchen. Mit den grafischen und programmatischen Modellierungstools in SimBiology können Sie:

  • Externe Daten analysieren und visualisieren, ein PK-Modell aus dem PK Wizard identifizieren und Ihr Modell an die externen Daten anpassen
  • Ein Reaktionsnetzwerk implementieren und damit die Systemdynamik untersuchen
  • Mehrere Modelle wie die PK mit einem biochemischen Netzwerk kombinieren
  • Ergebnisse mit einem automatisch erstellten Bericht zur Verfügung stellen

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